農林水産省は、８月６日からの豪雨による農業関係の被害を初めて発表した。それによると８月18日午前７時現在で、農地被害3,133か所（22府県）、農業用施設1,968か所（20県）のほか、倒伏や冠水など６県で農作物そのものにも被害があることが分かった。この時点では具体的な数量が判明しておらず、被害額も明らかにしていない。水稲を中心とした農業被害の内訳は以下の通り。
| 青 森 | ・農地３か所、農業用施設１か所で被害 |
| 秋 田 | ・農地74か所、農業用施設31か所で被害 |
| 山 形 | ・農地３か所、農業用施設５か所で被害 |
| 長 野 | ・農地７か所、農業用施設１か所で被害 |
| 静 岡 | ・農地１か所で被害 |
| 新 潟 | ・農地147か所、農業用施設113か所で被害 |
| ・農作物の被害（水稲の畦畔崩落など） | |
| 富 山 | ・農地319か所、農業用施設93か所で被害 |
| ・農作物の被害（水稲の倒伏被害など） | |
| 石 川 | ・農地339か所、農業用施設261か所で被害 |
| ・農作物の被害（水稲の浸水被害など） | |
| 大 阪 | ・農地２か所で被害 |
| 兵 庫 | ・農地１か所、農業用施設１か所で被害 |
| 岡 山 | ・農地７か所、農業用施設２か所で被害 |
| 鳥 取 | ・農地2か所、農業用施設1か所で被害 |
| 島 根 | ・農地36か所、農業用施設27か所で被害 |
| 山 口 | ・農地40か所、農業用施設37か所で被害 |
| 福 岡 | ・農地121か所、農業用施設168か所で被害 |
| ・農作物等の被害（水稲の冠水など） | |
| 佐 賀 | ・農地24か所、農業用施設17か所で被害 |
| 長 崎 | ・農地226か所、農業用施設126か所で被害 |
| 熊 本 | ・農地887か所、農業用施設622か所で被害 |
| ・農作物等の被害（水稲の冠水など） | |
| 大 分 | ・農地125か所、農業用施設６か所で被害 |
| 宮 崎 | ・農地５か所、農業用施設11か所で被害 |
| 鹿児島 | ・農地753か所、農業用施設435か所で被害 |
| ・農作物等の被害（水田への土砂流入など） | |
| ・共同利用施設の浸水 |